冷库卫生保洁不容忽视，低温能够很好的影响微生物活动频率，能够杀灭一般的微生物。但是一些能够耐低温的微生物，在冷库设备的低温下依然能够正常成长。因此不要错误的以为蔬菜水果放进了冷库就能长时间的确保它们不会受到冷库内周围环境的污染了，冷库设备的定期清洁需要定期并细心的进行，不能给影响冷藏品质量的微生物存活的机会，冷库设备的日常清洁消毒要注意以下几点:
1.保持冷库设备的清洁，冷凝器等设备要经常的进行检查和清扫工作，冷库中寄存各类物品的货架、用具等也要定期的进行清洁工作。确保设备和存放物品都是清洁的。
2.物品要分类寄存，冷库中的物品存放要特别的注意进行分类存放，避免因为交叉微生物感染或者存放条件要求不同导致冷冻损坏；清洁质量差的食物与清洁质量高的食物，短时间寄存的食物和长期寄存的食物，有异味的食物(如洋葱和水产品等)和易于吸收气味的食物，都要分隔寄存。
3.冷库内部的防害、防尘 保持冷库内部的洁净。避免老鼠进入冷库对食物进行损坏以及尘埃对食物的污染。
4.设备要定时消毒 冷库内外都要定时进行消毒，并且消毒后要给冷库进行通风换气。库体和冷库上面的天花板上有必要粉刷抗霉剂， 防止霉菌的滋生。 而冷库的消毒方式可以选用消毒液喷洒的，最好选用紫外线灭菌方式。